Alma Ata lahir sebagai tanggapan para cendekiawan muslim dan para ulama terhadap perkembangan zaman, kecenderungan perubahan peradaban pola hidup, dan perilaku manusia dewasa ini, dan merupakan bagian dari refleksi tanggung jawab moral keagamaan untuk membuktikan bahwa "Islam is always suitable to be a way of life anytime and anywhere" bahwa "Islam sholichun fi kulli zaman wa makan". Untuk merealisasikan misi luhur dari Alma Ata tersebut, dibutuhkan Visi dan Misi yang baik dan dapat mengakomodir perkembangan zaman.
Pada tahun 2040 UAA menjadi universitas yang unggul, mandiri, berdaya saing global, berkontribusi terhadap pembangunan kesejahteraan bangsa dan peradaban dunia berlandaskan nilai-nilai keislaman dan kebangsaan Indonesia.